С конца октября до середины декабря 1960 г. Nautilus находился в Средиземном море в составе 6-го флота ВМС США. После этого лодка участвовала в ряде учений НАТО в Атлантике. Осенью 1962 г. субмарина принимала участие в морской блокаде Кубы.
С 17 января 1964 г. по 15 мая 1966 г. состоялся второй капитальный ремонт и перезарядка активной зоны ЯР. К весне 1966 г. АПЛ прошла под водой 300000 миль. В течение следующих двенадцати лет она участвовала в ряде исследовательских программ ВМС.
10 ноября 1966 года Nautilus в ходе учений в перископном положении маневрировал, готовясь атаковать авианосец USS Essex (CVS-9). От столкновения авианосец получил подводную пробоину, но остался на плаву. Лодка серьёзно повредила рубку, но хода не лишилась и ушла в базу на ремонт.
Весной 1979 г. Nautilus отправился из Гротона в свой последний подводный переход на верфь Mare Island Naval Shipyard, где корабль был выведен из состава флота.
3 марта 1980 г. Nautilus после 25 лет службы был исключен из состава флота.
Повреждения после столкновения с USS Essex
С 17 января 1964 г. по 15 мая 1966 г. состоялся второй капитальный ремонт и перезарядка активной зоны ЯР. К весне 1966 г. АПЛ прошла под водой 300000 миль. В течение следующих двенадцати лет она участвовала в ряде исследовательских программ ВМС.
10 ноября 1966 года Nautilus в ходе учений в перископном положении маневрировал, готовясь атаковать авианосец USS Essex (CVS-9). От столкновения авианосец получил подводную пробоину, но остался на плаву. Лодка серьёзно повредила рубку, но хода не лишилась и ушла в базу на ремонт.
Весной 1979 г. Nautilus отправился из Гротона в свой последний подводный переход на верфь Mare Island Naval Shipyard, где корабль был выведен из состава флота.
3 марта 1980 г. Nautilus после 25 лет службы был исключен из состава флота.