Сколько видов жизни можно найти в стакане океанской воды?
Даже школьный микроскоп покажет, что стакан воды кишит жизнью. Теперь ученые идут дальше, используя секвенирование эДНК, чтобы выявить тысячи видов в одной капле.
Если вы когда-нибудь участвовали в школьном эксперименте, рассматривая под микроскопом океанскую или речную воду, вы знаете, что даже в одной капле кипит жизнь - от личинок и рыб, видимых невооруженным глазом, до бактерий, рыбьей икры, зоопланктона и других крошечных существ, которые можно увидеть только при большом увеличении. Теперь ученые стали смотреть еще пристальнее, используя относительно недавно появившуюся технику секвенирования экологической ДНК (эДНК). Это позволяет исследователям выделять частичную ДНК или РНК из образца воды, амплифицировать ее (делать копии), а затем сопоставлять с известными эталонными последовательностями. С помощью эДНК можно не только идентифицировать тысячи видов в одном образце воды (или почвы, или даже воздуха), этот метод можно использовать в полевых условиях для оценки биоразнообразия в водной и других средах быстрее, более полно и в то же время гораздо менее инвазивно, чем традиционные физические исследования.
Потребность в этой технологии растет так быстро, что в феврале в Хобарте прошла первая конференция по ДНК в Австралии и Новой Зеландии, собравшая ведущих исследователей и поставщиков технологий в этой области. Многое еще предстоит узнать. Из-за техники амплификации ДНК малейшее загрязнение может дать ложные результаты. Ученые также все еще изучают, как распределяется эДНК в окружающей среде, как далеко она распространяется от "точки выброса" и как различные качества воды влияют на то, насколько хорошо она перемешивается в толще воды.
Если вы когда-нибудь участвовали в школьном эксперименте, рассматривая под микроскопом океанскую или речную воду, вы знаете, что даже в одной капле кипит жизнь - от личинок и рыб, видимых невооруженным глазом, до бактерий, рыбьей икры, зоопланктона и других крошечных существ, которые можно увидеть только при большом увеличении. Теперь ученые стали смотреть еще пристальнее, используя относительно недавно появившуюся технику секвенирования экологической ДНК (эДНК). Это позволяет исследователям выделять частичную ДНК или РНК из образца воды, амплифицировать ее (делать копии), а затем сопоставлять с известными эталонными последовательностями. С помощью эДНК можно не только идентифицировать тысячи видов в одном образце воды (или почвы, или даже воздуха), этот метод можно использовать в полевых условиях для оценки биоразнообразия в водной и других средах быстрее, более полно и в то же время гораздо менее инвазивно, чем традиционные физические исследования.
Потребность в этой технологии растет так быстро, что в феврале в Хобарте прошла первая конференция по ДНК в Австралии и Новой Зеландии, собравшая ведущих исследователей и поставщиков технологий в этой области. Многое еще предстоит узнать. Из-за техники амплификации ДНК малейшее загрязнение может дать ложные результаты. Ученые также все еще изучают, как распределяется эДНК в окружающей среде, как далеко она распространяется от "точки выброса" и как различные качества воды влияют на то, насколько хорошо она перемешивается в толще воды.